Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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UBQLN4Q9NRR5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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UBQLN4Q9NRR5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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UBQLN4Q9NRR5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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UBQLN4Q9NRR5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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