Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHST12Q9NRB3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms