Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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LHX9Q9NQ69 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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LHX9Q9NQ69 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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