Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ASCL3Q9NQ33 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms