Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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