Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms