Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFDQ9GZP0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFDQ9GZP0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFDQ9GZP0 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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