Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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FOXQ1Q9C009 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FOXQ1Q9C009 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FOXQ1Q9C009 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FOXQ1Q9C009 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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