Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF17Q9BXT8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF17Q9BXT8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms