Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BBS2Q9BXC9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BBS2Q9BXC9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms