Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUSC1Q9BVN2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUSC1Q9BVN2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms