Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms