Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP9Q99956 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms