Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS8Q99627 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms