Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms