Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms