Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCZQ96LD1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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