Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TP53INP1Q96A56 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms