Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms