Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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