Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf43Q8TAL5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms