Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms