Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LTBP4Q8N2S1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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