Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYNE4Q8N205 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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