Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC83Q8IWF9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC83Q8IWF9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC83Q8IWF9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC83Q8IWF9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC83Q8IWF9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC83Q8IWF9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC83Q8IWF9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC83Q8IWF9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC83Q8IWF9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC83Q8IWF9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC83Q8IWF9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC83Q8IWF9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms