Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms