Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms