Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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