Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H3F3CQ6NXT2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms