Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNS3Q68CZ2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms