Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PRAMEF20Q5VT98 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PRAMEF20Q5VT98 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PRAMEF20Q5VT98 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PRAMEF20Q5VT98 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PRAMEF20Q5VT98 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PRAMEF20Q5VT98 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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PRAMEF20Q5VT98 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF20Q5VT98 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PRAMEF20Q5VT98 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PRAMEF20Q5VT98 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PRAMEF20Q5VT98 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PRAMEF20Q5VT98 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PRAMEF20Q5VT98 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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