Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIF1Q5UIP0 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms