Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBM48Q5RL73 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RBM48Q5RL73 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms