Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM61Q5EBN2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms