Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms