Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RFTN2Q52LD8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms