Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIN7

RGL3, Ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGL3Q3MIN7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGL3Q3MIN7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms