Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ISXQ2M1V0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms