Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDO1Q16878 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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