Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms