Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ZNF239Q16600 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ZNF239Q16600 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ZNF239Q16600 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF239Q16600 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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