Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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