Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms