Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms