Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRKQ15262 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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