Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LAPTM4AQ15012 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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