Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPRHQ149N8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPRHQ149N8 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
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