Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLINT1Q14677 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms