Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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