Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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